如實(shí)驗(yàn)室的擴(kuò)增產(chǎn)物泄露，造成實(shí)驗(yàn)室的污染，那么后果將非常嚴(yán)重。要去除污染，
①首先最重要的是保持通風(fēng)，保證擴(kuò)增產(chǎn)物片段能順利擴(kuò)散出去；
②其次可采用稀酸處理法，對可疑器具用1mol/L鹽酸擦拭或浸泡，使殘余DNA脫嘌呤；
③再次采用紫外照射法，紫外波長（nm）一般選擇254/300nm，需要注意的是，選擇UV作為消除殘留PCR產(chǎn)物污染時，要考慮PCR產(chǎn)物的長度與產(chǎn)物序列中堿基的分布，UV照射僅對500bp以上長片段有效，對短片段效果不大；
④最后若污染長時間不能消除，建議更換另外廠家的PCR試劑進(jìn)行檢測。

要判斷自己的PCR儀器是否正常，可從以下幾方面考慮：
1.儀器開關(guān)機(jī)，與軟件連接是否正常。
2.儀器運(yùn)行同樣的實(shí)驗(yàn)所需要的時間是否跟平時一致，由此判斷儀器的加熱制冷模塊是否正常。
3.曲線結(jié)果是否呈明顯的S型，若曲線異常，如呈曲折上升狀，則可能是熱蓋問題，或者是熒光檢測裝置出現(xiàn)問題，或者是電壓問題。
4.若曲線的熒光值與平時相比，明顯降低，則要考慮是否需要更換儀器光源（尤其是鹵素?zé)簦涔庠磯勖s2000h）。
5.若儀器某一孔或幾孔的熒光值明顯高于其他孔位，則需要考慮儀器的孔槽或檢測光路是否受到熒光污染，建議清洗儀器孔槽后并校準(zhǔn)后再進(jìn)行測試。

1）為了保證檢測質(zhì)量，PCR實(shí)驗(yàn)室應(yīng)有充分合理的空間，良好的照明和空調(diào)設(shè)備。工作環(huán)境雖不是檢測質(zhì)量的直接原因，但寬敞舒適的實(shí)驗(yàn)室環(huán)境將肯定有利于檢驗(yàn)質(zhì)量的保證。
2）合理有效地對儀器設(shè)備進(jìn)行管理，定期做維護(hù)和校準(zhǔn)，使其處于一個良好的狀態(tài)。例如，定期校準(zhǔn)移液器，使其保持足夠的準(zhǔn)確度和精密度。定期維護(hù)熒光定量PCR儀的光學(xué)系統(tǒng)和反應(yīng)孔間溫度差異，使其保持在良好狀態(tài)和允許的范圍內(nèi)。此外，還包括天平，離心機(jī)，冰箱等設(shè)備的管理。
3）理想的試劑：主要有內(nèi)外兩個因素，內(nèi)在因素包括標(biāo)本處理方法，用于核酸擴(kuò)增的原材料及方法學(xué)設(shè)計(jì)等。外出因素包括試劑盒的運(yùn)輸和保存中的問題。
4）標(biāo)準(zhǔn)化操作流程：完整的PCR程序由標(biāo)本采集，運(yùn)送，保存，編號，試劑準(zhǔn)備，核酸提取，擴(kuò)增和產(chǎn)物檢測，結(jié)果分析和報告等諸多環(huán)節(jié)，建立科學(xué)和與本實(shí)驗(yàn)室配套的SOP文件，嚴(yán)格按SOP進(jìn)行操作。
5）主要污染源和防污染措施：PCR的主要污染源有標(biāo)本中的大量待測微生物，克隆質(zhì)粒，大量存在實(shí)驗(yàn)室中的特定微生物以及以前擴(kuò)增產(chǎn)物的殘留污染等。這些都是實(shí)驗(yàn)室最容易造成假陽性的污染。因此，必須嚴(yán)格分區(qū)實(shí)驗(yàn)室及遵守工作流程，使用化學(xué)清潔實(shí)驗(yàn)臺面，使用紫外線照射和UNG方法消除擴(kuò)增產(chǎn)物污染等等。
6）進(jìn)行室內(nèi)和室間質(zhì)量控制，室內(nèi)質(zhì)量控制可以確保實(shí)驗(yàn)室室內(nèi)測定質(zhì)量的一致性，室間質(zhì)量控制可以提供將實(shí)驗(yàn)室測定情況與一室間和客觀標(biāo)準(zhǔn)進(jìn)行回顧性比較的數(shù)據(jù)。

實(shí)時熒光定量PCR擴(kuò)增曲線包括基線期，指數(shù)擴(kuò)增期，線性擴(kuò)增期和擴(kuò)增平臺期，標(biāo)準(zhǔn)的曲線應(yīng)該呈典型的S型。不規(guī)則曲線可以根據(jù)曲線的具體情況來分析：
1）曲線呈斜線上升原因：熱蓋失靈或熱蓋沒蓋緊，導(dǎo)致控溫不準(zhǔn)、液體揮發(fā)。解決辦法:更換儀器熱蓋或?qū)嵘w蓋緊。
2）擴(kuò)增曲線分成兩段（斷裂）原因：基線的終點(diǎn)大于Ct值，通常是因?yàn)槟０錎NA濃度偏高，CT值< 15，而基線仍然取3-15，其中包含部分?jǐn)U增信號，導(dǎo)致曲線被壓下去。解決方法：減小基線終點(diǎn)，至Ct值前4個循環(huán)，重新分析數(shù)據(jù)。
3）直線擴(kuò)增曲線，某些樣本出現(xiàn)直線擴(kuò)增曲線原因：探針部分降解解決辦法:建議更換試劑進(jìn)行測試。
4）曲線平臺期下掉原因：蓋子沒蓋緊解決辦法:PCR反應(yīng)管蓋子蓋上后，檢查蓋子是否蓋緊。